Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTNP04004 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VTNP04004 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VTNP04004 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTNP04004 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTNP04004 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTNP04004 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTNP04004 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTNP04004 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTNP04004 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VTNP04004 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTNP04004 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTNP04004 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTNP04004 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTNP04004 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTNP04004 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VTNP04004 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTNP04004 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTNP04004 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTNP04004 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VTNP04004 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTNP04004 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTNP04004 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTNP04004 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTNP04004 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTNP04004 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTNP04004 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTNP04004 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTNP04004 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTNP04004 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTNP04004 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTNP04004 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTNP04004 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTNP04004 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTNP04004 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTNP04004 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms