Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMNAP02545 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNAP02545 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNAP02545 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNAP02545 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNAP02545 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNAP02545 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNAP02545 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNAP02545 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNAP02545 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNAP02545 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNAP02545 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNAP02545 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNAP02545 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNAP02545 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNAP02545 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNAP02545 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNAP02545 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms