Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYF2O95926 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYF2O95926 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYF2O95926 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYF2O95926 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYF2O95926 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYF2O95926 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYF2O95926 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYF2O95926 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYF2O95926 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYF2O95926 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYF2O95926 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYF2O95926 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYF2O95926 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYF2O95926 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYF2O95926 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYF2O95926 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYF2O95926 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYF2O95926 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYF2O95926 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYF2O95926 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYF2O95926 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYF2O95926 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYF2O95926 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYF2O95926 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYF2O95926 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYF2O95926 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYF2O95926 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYF2O95926 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYF2O95926 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYF2O95926 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYF2O95926 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYF2O95926 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYF2O95926 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYF2O95926 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYF2O95926 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYF2O95926 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms