Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE8BO95263 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE8BO95263 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms