Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC24DO94855 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24DO94855 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms