Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA3O75764 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA3O75764 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms