Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
TRMUO75648 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRMUO75648 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMUO75648 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMUO75648 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMUO75648 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMUO75648 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMUO75648 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRMUO75648 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRMUO75648 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRMUO75648 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRMUO75648 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRMUO75648 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms