Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F6O75461 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F6O75461 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F6O75461 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F6O75461 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F6O75461 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F6O75461 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F6O75461 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F6O75461 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms