Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms