Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP12O75317 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP12O75317 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP12O75317 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP12O75317 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP12O75317 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP12O75317 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP12O75317 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP12O75317 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP12O75317 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms