Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPHN1O60890 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms