Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REV3LO60673 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REV3LO60673 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REV3LO60673 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REV3LO60673 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REV3LO60673 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REV3LO60673 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REV3LO60673 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REV3LO60673 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REV3LO60673 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REV3LO60673 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REV3LO60673 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REV3LO60673 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REV3LO60673 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REV3LO60673 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
REV3LO60673 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REV3LO60673 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV3LO60673 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV3LO60673 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV3LO60673 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV3LO60673 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV3LO60673 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
REV3LO60673 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV3LO60673 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV3LO60673 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms