Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B3O60423 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms