Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3BO60391 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN3BO60391 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms