Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP10AO60312 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP10AO60312 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms