Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LANCL1O43813 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms