Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BUD23O43709 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BUD23O43709 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BUD23O43709 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BUD23O43709 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BUD23O43709 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BUD23O43709 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BUD23O43709 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BUD23O43709 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BUD23O43709 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BUD23O43709 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BUD23O43709 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms