Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI1O43347 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI1O43347 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSI1O43347 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSI1O43347 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSI1O43347 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSI1O43347 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSI1O43347 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MSI1O43347 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MSI1O43347 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI1O43347 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI1O43347 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI1O43347 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI1O43347 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms