Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRGAP3O43295 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms