Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SART1O43290 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SART1O43290 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SART1O43290 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SART1O43290 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SART1O43290 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SART1O43290 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SART1O43290 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SART1O43290 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SART1O43290 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SART1O43290 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SART1O43290 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SART1O43290 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SART1O43290 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SART1O43290 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SART1O43290 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SART1O43290 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SART1O43290 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SART1O43290 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SART1O43290 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SART1O43290 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SART1O43290 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SART1O43290 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SART1O43290 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SART1O43290 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SART1O43290 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms