Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD3O43242 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD3O43242 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms