Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLXNB1O43157 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms