Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6BO15054 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM6BO15054 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM6BO15054 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms