Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KTA2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
J3KTA2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KTA2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KTA2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KTA2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KTA2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KTA2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KTA2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KTA2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms