Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRRM5B3KS81 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRRM5B3KS81 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms