Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5BA8MYB1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5BA8MYB1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5BA8MYB1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5BA8MYB1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5BA8MYB1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO5BA8MYB1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms