Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
WTIPA6NIX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
WTIPA6NIX2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
WTIPA6NIX2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
WTIPA6NIX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms