Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms