Protein–RNA interactions for Protein: A6NDX5

ZNF840P, Putative zinc finger protein 840, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF840PA6NDX5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF840PA6NDX5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF840PA6NDX5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms