Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms