Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POTEB3A0JP26 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms