Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MTND6P14-201ENST00000433044 522 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC091893.1-201ENST00000503772 399 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC092295.2-201ENST00000592087 1392 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ANXA13-202ENST00000419625 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PCYT1A-206ENST00000431016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 BEND3P2-201ENST00000414425 2254 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 C10orf99-201ENST00000372126 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PAGE4-202ENST00000376141 487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PGAM1P7-201ENST00000413837 737 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 HS1BP3-IT1-201ENST00000449391 600 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CHIA-207ENST00000451398 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC114321.1-201ENST00000520075 533 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ZNF576-204ENST00000528387 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC079779.3-201ENST00000588842 1200 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.186-201ENST00000617234 362 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CLEC17A-203ENST00000547437 2065 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RNF167-207ENST00000572430 1511 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC073263.2-201ENST00000624835 1863 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LRRC63-202ENST00000446175 2114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 WASH2P-201ENST00000453662 1684 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 BHLHB9P1-201ENST00000553845 1651 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AL365259.1-204ENST00000606001 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TMEM253-201ENST00000418511 1526 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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