Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ZNF583-201ENST00000291598 2538 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CSF2RA-208ENST00000417535 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CDK5-201ENST00000297518 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL451165.1-201ENST00000334441 328 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC023115.1-201ENST00000450944 574 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PSCA-204ENST00000513264 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC023194.3-202ENST00000524253 364 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC023078.3-201ENST00000527463 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ZNF576-204ENST00000528387 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 OR13C2-201ENST00000542196 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 GLTP-205ENST00000544393 914 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC084033.3-203ENST00000546580 571 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LINC02450-201ENST00000550177 1003 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ATP6V1D-210ENST00000555474 1102 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC087699.1-201ENST00000558111 393 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC022167.1-201ENST00000564919 409 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RN7SL811P-201ENST00000580735 298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 IGHV1OR15-1-201ENST00000604066 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 FAM74A7-201ENST00000613652 727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC135068.8-201ENST00000630556 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC012442.3-201ENST00000636053 940 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL590556.2-201ENST00000637118 1162 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 COQ10A-203ENST00000546544 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PLSCR4-202ENST00000383083 3033 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 GEMIN8-202ENST00000380523 1682 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL365259.1-204ENST00000606001 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 APOL3-201ENST00000349314 2117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P46-201ENST00000411735 937 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LINC01044-201ENST00000413637 657 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC023347.1-201ENST00000435352 604 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL354676.1-201ENST00000458047 368 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RN7SL304P-201ENST00000488028 301 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PRAMENP-203ENST00000548391 1445 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC009654.1-201ENST00000560503 757 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC007923.3-201ENST00000578645 292 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LINC01651-201ENST00000624642 350 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SP100-203ENST00000409112 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms