Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 METTL3-201ENST00000298717 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 GNL3-201ENST00000394799 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MAPT-208ENST00000431008 1233 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC118553.1-201ENST00000454219 655 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RN7SL743P-201ENST00000475032 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AP002986.1-203ENST00000602310 330 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC010326.4-202ENST00000603829 541 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FP236383.2-201ENST00000625598 923 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FP236383.3-201ENST00000627981 923 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FP671120.3-201ENST00000631211 923 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ELMO2-201ENST00000290246 3669 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SLC16A7-216ENST00000552432 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TMEM106B-202ENST00000396668 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 IQCC-201ENST00000291358 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 IP6K3-202ENST00000451316 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RNF167-207ENST00000572430 1511 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ZNF772-209ENST00000615214 1506 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 REG1B-201ENST00000305089 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CFAP58-201ENST00000369703 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC01135-201ENST00000419531 996 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 JPT1-208ENST00000481647 576 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC105020.5-201ENST00000614810 423 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC00595-212ENST00000634933 1544 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PRPSAP2-228ENST00000610773 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC011487.2-202ENST00000599707 1356 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CEP57-210ENST00000538658 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 WASH2P-201ENST00000453662 1684 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC007906.2-202ENST00000619363 1687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 C17orf64-201ENST00000269127 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms