Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RN7SK-201ENST00000636484 328 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SNAP25-201ENST00000254976 2053 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 BEND3P2-201ENST00000414425 2254 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PMS1-204ENST00000409823 2795 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RAE1-209ENST00000527947 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PGAP2-235ENST00000532523 1696 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 FRMD6-204ENST00000553556 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 KRTAP19-4-201ENST00000334058 310 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 KRTAP4-2-201ENST00000377726 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL357055.2-201ENST00000412567 434 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RPSAP19-201ENST00000431241 880 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL139011.1-201ENST00000442130 557 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LRRC63-202ENST00000446175 2114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 HS1BP3-IT1-201ENST00000449391 600 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC091893.1-201ENST00000503772 399 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 KRT19P3-201ENST00000507547 828 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC008525.2-201ENST00000511000 82 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC079779.3-201ENST00000588842 1200 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL157392.3-201ENST00000601075 833 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.186-201ENST00000617234 362 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CT55-202ENST00000344129 1728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AF131215.4-201ENST00000526648 1741 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TMEM253-201ENST00000418511 1526 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TLR8-AS1-201ENST00000451564 1349 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PSMC1P1-201ENST00000478110 1320 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 KRT31-201ENST00000251645 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CHI3L2-201ENST00000369744 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 C10orf99-201ENST00000372126 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 C22orf15-203ENST00000402217 829 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SYP-AS1-201ENST00000433499 542 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 UBTFL5-201ENST00000443682 1191 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC010267.1-201ENST00000508636 553 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 SCAMP1-AS1-202ENST00000513755 493 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 LINC02163-201ENST00000514769 574 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 ODF3-203ENST00000525282 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P62-201ENST00000559372 952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIRT1Q96EB6 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms