Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MAP3K4Q9Y6R4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms