Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI1Q9Y6G9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms