Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP3Q9Y6F1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms