Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD54BQ9Y620 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms