Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms