Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP16Q9Y5T5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms