Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD2APQ9Y5K6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD2APQ9Y5K6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD2APQ9Y5K6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CD2APQ9Y5K6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms