Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF2Q9Y4G8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF2Q9Y4G8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms