Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms