Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9Y3F1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9Y3F1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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