Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZDHHC9Q9Y397 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC9Q9Y397 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC9Q9Y397 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms