Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2J1Q9Y385 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2J1Q9Y385 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.5 ms