Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms