Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIKFYVEQ9Y2I7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms