Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM33Q9UPN9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms